农业部儋州木薯种质资源圃始建于1963年，前身为中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所木薯研究室种质保存基地，2009年3月由农业部授权成立并通过验收。2000年至今，通过与国际热带农业研究中心（CIAT）、泰国农业部、巴西国家农牧研究院（EMBRAPA）和尼日利亚农业部等合作，收集、保存了泰国、越南、巴西、哥伦比亚等国内外木薯核心种质资源609份，引进国外特异种子10余万粒，先后选育出自主创新的“华南6068”、“华南8013”、“华南8002”、“华南124”、“华南5号”、“华南6号”、“华南7号”、“华南8号”、“华南9号”、“华南10号”、“华南11号”、“华南12号”、“华南13号”等具有高产、高淀粉、抗逆性强和食用等特性华南系列木薯新品种13个。
农业部儋州木薯种质资源圃主要开展木薯种质资源的收集、保存、评价和创新利用研究，按照国家要求，对木薯国内外种质有计划地进行收集、整理、鉴定、保存、编目、共享和利用，制定及完善木薯种质资源特性描述规范和数据标准，构建我国木薯种质资源收集、保存、整理、评价技术体系，为全国木薯育种、生产和其他科研需要服务。
农业部儋州木薯种质资源圃现有固定研究人员21人，包括研究员3人，副研究员6人，博士6人。多年来，先后承担了国家科技部、农业部、南亚办等相关部门的重大项目，包括“973”项目、“863”项目、“948”项目、国家木薯产业技术体系项目，国家自然科学基金项目、木薯行业科技项目、跨越计划项目、国家科技支撑计划项目、国家外专局项目和农业行业科技专项等。2009年，“木薯品种选育及产业化关键技术研发集成与应用”获国家科学技术进步奖二等奖。2013年，木薯种质资源收集、保存及应用研究团队荣获农业部“全国农业先进集体”光荣称号。
